La CMT est due à une anomalie génétique transmise par un au moins des parents.
Dans les formes à transmission dominante, l'un des parents est lui-même malade, parfois sans signes cliniques : chacun de ses enfants, quel que soit le sexe, a un risque sur deux d'hériter de l'anomalie.
Pour les formes à transmission récessive, il faut que les deux parents, eux-mêmes porteurs sains, soient porteurs de l'anomalie génétique. Leurs enfants auront 25% de chance d'être indemnes, 50% de risque d'être porteurs sains et 25% de risque de développer la maladie. Ceux qui seront porteurs sains de même que ceux qui seront malades peuvent transmettre l'anomalie génétique mais ont très peu de risque d'avoir à leur tour des enfants malades : ce n'est possible que si leur conjoint est également porteur de l'anomalie.
Dans les formes assez fréquentes de CMT liée à l'X, la transmission sera variable selon le sexe du parent atteint et de l'enfant : une mère CMT aura un risque sur deux de transmettre la maladie à chacun de ses enfants, quel que soit le sexe, tandis qu'un père CMT transmettra le gène défectueux à ses filles uniquement.
Formes sporadiques : il faut signaler aussi quelques cas de mutation génétique spontanée, sans manifestation de la maladie connue dans la famille, ainsi que des cas où la transmission héréditaire est difficile à discerner, faute de renseignements sur la famille.